בעקבות ההסלמה במצב הביטחוני, עם פרוץ מלחמת לבנון השנייה וההסלמה בעוטף עזה, חידשה הסוכנות היהודית בינואר  2006 פעילות הקרן לנפגעי טרור. פעילות הקרן התאפשרה הודות לתרומות מאיחוד הקהילות היהודית של צפון אמריקה (UJC), קרן היסוד והקרן לידידות ירושלים. הקרן, מעניקה סיוע משלים, באופן ישיר, לנפגעי פעולות איבה שנפגעו מיום ה- 1  בינואר 2006 ועד שנתיים מיום הפגיעה . הקרן  פועלת בראשות שופט וכוללת את נציגי משרד הביטחון, המוסד לביטוח לאומי, משרד הקליטה והסוכנות היהודית.  כל חודש מקיימת הקרן ישיבה של ועדה מקצועית הדנה בכל בקשה ומאשרת אותה, בהתאם לקריטריונים ולזכאות. מסירת הצ'קים הינה ישירה על ידי נציגי הקרן ועובדי אזור ישראל בנציגיות צפון, מרכז ודרום.

הקרן פועלת כיום בשתי צורות :

הקרן הכללית- הסיוע ניתן לנפגעי פעולות איבה וטרור שהוכרו על ידי המוסד לביטוח לאומי. גובה הסיוע עד 25,000 שקל, במקרים מיוחדים  הסיוע מגיע עד 50 אלף שקל. ניתן להגיש בקשה לקרן עד שנתיים מקרות האירוע. (אירועים שקרו החל מינואר 2006 ואילך). הבקשות לקרן מתקבלות ממשרד הביטחון/ ביטוח לאומי. לא פנייה ישירה של אזרחים. חיילים, אזרחים ומשפחות שכולות יכולים לבקש סיוע כמו רכישת אביזרים ביתיים, שכר דירה, שכר לימוד (לימודי תואר, קורסים, חוגים, שיעורי עזר וכד'), טיפולי שיניים, וסיוע כלכלי. בנושא הנצחה הקרן מעניקה סיוע של עד 1000$.

קרן החירום  - הפועלת בעיקר בשדרות ועוטף עזה.

תוך 48 שעות מאירוע נפילת קאסם / פצמ"ר ניתן סיוע לצורך התארגנות ראשונית, בגובה של 1000$.  כמו למשל סל מזון, מגורים זמניים אם הבית נפגע, שירות אמבולנס וכו'. לצורך קבלת סיוע זה, אין צורך להיות מוכרים כנפגעי טרור/ פעולות איבה. הבקשות לקרן החירום מופנות לנציגי אזור ישראל דרך מחלקות הרווחה או ישירות על ידי הנפגעים. בנוסף נציגי אזור ישראל יוזמים סיוע מיידי (כמו שנעשה בנפילת הגראד באשקלון). הסיוע ניתן למי שנפגע פיזית או נפשית, ובטווח של עד 3 חודשים מהאירוע.

עוד נתונים על הקרן לנפגעי טרור

• מנהל הקרן - אלי כרמלי, מנהל קשרי ציבור בנציגות מרכז.
• רכזת הקרן - הילה מלמוד
• 667 משפחות קיבלו סיוע מהקרן הכללית ברחבי הארץ.
• 415 משפחות קיבלו סיוע דרך קרן החירום בשדרות ועוטף עזה.
• מס' הטלפון של הקרן: 03-7453542