1. חבר הנאמנים
חבר הנאמנים קובע את מדיניותה של הסוכנות היהודית לארץ ישראל ומנהל, מפקח, מכוון ושולט על פעולותיה ופעילויותיה. כל הגופים (למעט העצרת), בעלי תפקידים ופקידי הסוכנות היהודית יפעלו בהתאם ובמסגרת המדיניות שתיקבע על ידי העצרת וחבר הנאמנים, ויהיו אחראים בפני חבר הנאמנים. בתקופה שבין כינוסי העצרת, תהא לחבר הנאמנים סמכות מלאה לפעול בשם הסוכנות ולקבוע מדיניות, אך זאת בתנאי שהחלטותיו ופעולותיו לא יהיו בניגוד להחלטותיה או להוראותיה של העצרת.
2. העצרת
תפקידי העצרת הם:
3. ההנהלה
4. לשכת המזכיר הכללי
לשכת המזכיר הכללי משמשת כממשק בין חברי חבר הנאמנים והעצרת לבין הסוכנות היהודית. בהתאם לתקנון, המזכיר הכללי אחראי בפני יו"ר חבר הנאמנים ובפני יו"ר ההנהלה. הוא משמש כמזכיר העצרת, מזכיר חבר הנאמנים ומזכיר ההנהלה. עוד הוא אחראי על ציוות העצרת, חבר הנאמנים וועדותיו וההנהלה. בנוסף, המזכיר הכללי שומר ומתייק מסמכים רשמיים של הסוכנות היהודית, כולל פרוטוקולים והחלטות של העצרת, של חבר הנאמנים וההנהלה. לשכת המזכיר הכללי אחראית על תקנון הסוכנות היהודית ועל הסכם הכינון מחדש.